Das Chronic Covid Treatment Center Institutional Review Board hat das Protokoll überprüft und genehmigt. Alle Teilnehmer hatten schriftlich informierte Einwilligungen zur Teilnahme an der Forschung gegeben. Das Datum der akuten Covid-19-Infektion wurde als das Datum definiert, an dem der erste positive SARS-CoV-2-Test oder das Auftreten von Covid-19-Symptomen festgestellt wurde. Gesunde Kontrollteilnehmer hatten keine bekannte Vorgeschichte einer SARS-CoV-2-Infektion und eine negative Anti-NP-Assay zum Zeitpunkt der Teilnahme. Alle Patienten waren über 18 Jahre alt. Es wurden Methoden gemäß den relevanten Richtlinien und Vorschriften des Überprüfungsgremiums durchgeführt.
Die Inklusionskriterien für Personen in der LC-Gruppe waren eine zuvor bestätigte oder wahrscheinliche Covid-19-Infektion (gemäß den Richtlinien der Weltgesundheitsorganisation), Alter ≥ 18 Jahre, und anhaltende Symptome > 12 Wochen nach der anfänglichen Covid-19-Infektion. Symptome umfassten die zuvor beschriebenen und bewerteten. Die Inklusionskriterien für gesunde Kontrollen (HC) waren Alter ≥ 18 Jahre, keine frühere SARS-CoV-2-Infektion und eine negative Anamnese, die im Rahmen der Registrierung im Chronic COVID Treatment Center (CCTC) aufgenommen wurde. Patienten mit chronischer Lyme-Borreliose (CLD) hatten eine Vorgeschichte von Müdigkeit, Gehirnnebel und post-exertionaler Malaise, die vor der SARS-CoV-2-Pandemie (vor 2020) auftrat und länger als 6 Monate anhielt. Die Anwesenheit von Borrelia Burgdorferi-Spezies wurde durch zweizeitige immunologische Tests bestätigt.
Zur Konstruktion eines Arbeitsdatensatzes wurden Zytokinprofile aus drei Krankheitszuständen ausgewählt: Nicht gestört (NP), LC/PASC und CLD. Die Daten wurden in Python importiert und in Trainings- und Evaluierungsteilungen aufgeteilt. Zur Entwicklung von maschinelles Lernen Modellen wurden Entscheidungsbaum, Random Forest und Gradient Boosting Machine verwendet. Hyperparameter-Optimierung und Leistungsbewertung wurden durchgeführt. Ein Lyme-Index wurde erstellt, um zwischen PASC und Lyme-Patienten zu differenzieren. Die Vorhersage des Krankheitszustands von Patienten auf Blindstudien wurde mit dem bestperformenden Modell getestet. Alle Teilnehmer hatten ihre schriftliche informierte Einwilligung zur Teilnahme an der Studie gegeben, die von der IRB für das Chronic COVID Treatment Center genehmigt wurde.
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